京都的舞鹤港口,日本海上自卫队正在举行难得的搭乘宙斯盾驱逐舰体验航海活动。柯南、小兰、毛利小五郎和少年侦探团等人当选,与全国各地聚集来的孩子们一起登上了这艘装载着日本最先进武器的宙斯盾驱逐舰,体验着在电子武装下的高科技舰船上展开的惊心动魄的航海。突然,巨大的爆炸声响起,紧张不安的气氛在舰内蔓延。宙斯盾驱逐舰在表演过程中居然发射出实弹?!不久,海面上漂浮着自卫队员的遗体!而凶手到底会是谁?
知名建筑设计师森谷帝二这日邀请新一参加在他府上举办的茶会,柯南只能电话拜托小兰。柯南、小兰及毛利小五郎三人未入森府,已被绝对对称的宏伟建筑吸引。衣香鬓影的茶会上,森谷帝二令人诧异地大声攻击年轻设计师,讲建筑的美学准则要被他们破坏殆尽。柯南在规定时间内将他出给众宾客的难题破解,被获准和小兰一起参观陈有他设计图的展览馆,交谈中,他感慨30多岁初成名时的作品不够对称称不上完美,并从小兰口中打探到她要与新一在米花大楼约会为新一庆生的诸多细节。
主角平静的生活竟被一场突如其来的 “意外” 彻底打破 —— 在目睹一起离奇的密室杀人案后,他体内潜藏的 “SSS 级推理天赋” 骤然觉醒:散落的烟灰能还原凶手的作案时间,错位的家具摆放藏着密室的破解关键,甚至目击者不经意的微表情,都能成为他锁定真凶的铁证。每一个案件都堪称 “烧脑教科书”:从利用物理原理制造不在场证明的写字楼谋杀案,到隐藏着家族恩怨的古董盗窃案,再到与过去阴影相关的连环杀人案,线索环环相扣,反转层层递进。